侵權商標賠償的方式：一般由雙方自行協商賠償即可。若協商不成的，則賠償數額，按照權利人因被侵權所受到的實際損失確定，實際損失難以確定的，按照侵權所得予以賠償，侵權所得難以計算的，則按照該商標許可使用費的合理倍倍數予以賠償。
【法律依據】
《中華人民共和國商標法》第六十三條
侵犯商標專用權的賠償數額，按照權利人因被侵權所受到的實際損失確定；實際損失難以確定的，可以按照侵權人因侵權所獲得的利益確定；權利人的損失或者侵權人獲得的利益難以確定的，參照該商標許可使用費的倍數合理確定。對惡意侵犯商標專用權，情節嚴重的，可以在按照上述方法確定數額的一倍以上五倍以下確定賠償數額。賠償數額應當包括權利人為制止侵權行為所支付的合理開支。
人民法院為確定賠償數額，在權利人已經盡力舉證，而與侵權行為相關的賬簿、資料主要由侵權人掌握的情況下，可以責令侵權人提供與侵權行為相關的賬簿、資料；侵權人不提供或者提供虛假的賬簿、資料的，人民法院可以參考權利人的主張和提供的證據判定賠償數額。