申請人可以使用英語、法語和德語3種官方語言之一向歐洲專利局(EuropeanPatentOffice，EPO)提出申請。EPO會對與申請的專利性有關(guān)的現(xiàn)有技術(shù)文件進行檢索，當申請人接到檢索報告(從2005年開始歐洲專利局推出“加強的歐洲檢索”-即在申請日后6個月后與檢索報告一起出具一份關(guān)于專利性的簡短書面意見)時，通常需要根據(jù)檢索結(jié)果來評估其發(fā)明的專利性和獲得核準的可能。EPO于優(yōu)先權(quán)日(申請日)起18個月會公開專利申請。申請人應(yīng)在申請同時或在EPO的檢索報告公布日起6個月內(nèi)提出實質(zhì)審查請求。提出實審請求的同時，需從EPO成員國中指定具體成員國，并繳納實審費和指定費。在提出實審后1-3年內(nèi)會收到EPO的審查意見。
當審查被通過后，歐洲專利局將發(fā)出核準通知。申請人同意進入領(lǐng)證階段時，需付領(lǐng)證費并遞交專利申請范圍的其它兩種語言的譯文。同時申請人就必須決定在指定國名單中選擇生效國，通知EPO該專利要在哪些國家生效。確定生效國后，需要將此歐洲專利的全部內(nèi)容翻譯成該國的語言提交給該生效國，以便此歐洲專利在該國生效。一般成員國要求在核準公告起3個月內(nèi)完成翻譯工作并在各國生效。在不同國家生效的工作完成后，申請人即擁有不同國家的專利，他們相互獨立，每年各生效國都需繳納年費。
申請歐盟專利時，只要交納7個國家的指定費，就可以將專利申請指定到所有歐盟國家，但是如果想在各個國家得到保護，還必須在各個國家辦理證書手續(xù)，重要的是還需要翻譯為各個國家接受的語言，比如在德國必須用德語。
申請歐盟專利的費用是非常昂貴的，基本的申請費加檢索費是1170歐元，實質(zhì)審查費是1490歐元，加上7個國家的指定費560歐元，那么申請一個歐洲專利需要花費的官費就將近3000歐元，而國外專利律師的代理費還沒有計算，再加上國內(nèi)代理費，大約需要5-6萬元人民幣。
適用于所有指定締約國內(nèi)的歐盟專利異議程序是無效歐盟專利的唯一機會，如果喪失該機會，必須在不同的締約國內(nèi)提起單獨的國內(nèi)無效訴訟。
歐盟專利在授權(quán)后9個月內(nèi)可以提起異議，官費635歐元。德國專利在授權(quán)后3個月內(nèi)可以提起異議，官費200歐元。
專利的無效費用是相當高昂的，在德國無效一個專利的官費在2萬歐元。而實用新型沒有異議程序，其無效費用較低，僅需要300歐元。
綜上所述，在相應(yīng)的時間內(nèi)提起專利異議的費用較低。通過這樣加大成本的方式，使專利無效的提起相對困難，也保障了專利質(zhì)量。