祖?zhèn)髅胤奖旧硎强梢陨暾?qǐng)專利并且獲得專利權(quán)的，但是我不建議您申請(qǐng)專利。
專利是以公開技術(shù)內(nèi)容換取法律保護(hù)的，您在申請(qǐng)專利的過程中要公開配方、用量、制備方法、使用方法、有效量等等內(nèi)容，使您無秘可保。
專利申請(qǐng)并不復(fù)雜，而且如果有專業(yè)人士幫忙，也比較容易授權(quán)，只是會(huì)使秘方喪失保密性。
合法經(jīng)營主要是通過進(jìn)行藥品注冊(cè)，但只能以法人名義，而且費(fèi)用極高，可能還需要臨床試驗(yàn)。目前藥品轉(zhuǎn)讓環(huán)境不是很理想，我知道有一些已經(jīng)拿到臨床批文并且獲得專利的藥物都很難轉(zhuǎn)讓成功，所以建議您還是再考慮一下。
你必須依托正規(guī)醫(yī)療機(jī)構(gòu)（如果是農(nóng)村，你們縣醫(yī)院就可以），組織藥物臨床試驗(yàn)，整理出正式試驗(yàn)結(jié)果，也就是效果觀察報(bào)告。然后，這將構(gòu)成你申請(qǐng)材料中最重要的證據(jù)。

中華人民共和國知識(shí)產(chǎn)權(quán)局，上面十分詳細(xì)。別嫌麻煩，慢慢看。
http://www.sipo.gov.cn/sipo/zlsq/

申請(qǐng)專利的流程包括：
1）將專利申請(qǐng)文件（發(fā)明或?qū)嵱眯滦臀募?quán)利要求書、說明書、說明書附圖、摘要、摘要附圖）、請(qǐng)求書、申請(qǐng)費(fèi)（即，交給專利局的官費(fèi)）提交到專利局。
2）官方的受理通知書會(huì)在申請(qǐng)日之后兩周內(nèi)下發(fā)，其中列出該專利申請(qǐng)的申請(qǐng)日和申請(qǐng)?zhí)枺@些都作為未來專利局審查的唯一編號(hào)。3）專利局審查，最終合格后發(fā)出授權(quán)通知書，表明同意授權(quán)。
4）申請(qǐng)人進(jìn)行授權(quán)登記后專利授權(quán)公告生效。
第三，申請(qǐng)實(shí)用新型的標(biāo)準(zhǔn)官費(fèi)是500，如果符合個(gè)人費(fèi)用減緩條件可減至75；授權(quán)登記時(shí)還需交納205和授權(quán)當(dāng)年的年費(fèi)。如委托代理機(jī)構(gòu)還需要額外的代理費(fèi)。