區(qū)別如下：

1、保護(hù)原則不同

軟件著作權(quán)是在軟件創(chuàng)作完成后自動產(chǎn)生的，也是自愿進(jìn)行軟件著作權(quán)登記，登記的目的是體現(xiàn)公證的效力，主要用于聲明著作權(quán)權(quán)屬，同時使后續(xù)維權(quán)時的證據(jù)力度更大。

軟件專利則必須向?qū)＠痔岢錾暾埐拍塬@得保護(hù)，因此必須要積極申請，且專利制度也是以“用公開換保護(hù)”為原則。

2、保護(hù)依據(jù)不同

軟件著作權(quán)保護(hù)依據(jù)是《著作權(quán)法》和《計算機(jī)軟件保護(hù)條例》。軟件專利保護(hù)依據(jù)是《專利法》，具體審查標(biāo)準(zhǔn)參見國家知識產(chǎn)權(quán)局專利《審查指南》第二部分第九章“涉及計算機(jī)程序的發(fā)明專利申請審查若干問題”。

3、保護(hù)客體不同

軟件著作權(quán)申請?zhí)峤坏馁Y料是源代碼及用戶操作手冊，所以軟件著作權(quán)保護(hù)的是表現(xiàn)形式，不保護(hù)思想。這樣就有可能出現(xiàn)競爭對手將你的軟件進(jìn)行研究，然后改變編程語言，達(dá)到的結(jié)果是一樣的，但由于代碼不相同，所以不侵犯著作權(quán)。

軟件專利則不同，在申請時描述的是軟件的設(shè)計構(gòu)思（注意一定要以技術(shù)方案的形式表現(xiàn)，或者最好能夠結(jié)合硬件來表現(xiàn)），包含了軟件流程圖的內(nèi)容，而不是主要說明采用哪種程序語言實(shí)現(xiàn)。一旦獲權(quán)后，他人只要采用了軟件專利的設(shè)計構(gòu)思或方案，就可能構(gòu)成侵權(quán)。

4、通過率不同

軟件著作權(quán)實(shí)行的是登記制，一般不需要經(jīng)過實(shí)質(zhì)審查，只要形式審查時提交的材料符合要求，并且不違反《著作權(quán)法》的規(guī)定即可獲權(quán)，登記通過率極高。

軟件專利需要經(jīng)過形式審查和實(shí)際審查。一般純軟件型的專利不易獲權(quán)，通過軟硬件結(jié)合的方式會提高其授權(quán)率，但總得來說通過率依然不高。

5、保護(hù)期限不同

民的作品，其法律規(guī)定的相關(guān)著作權(quán)保護(hù)期為作者有生之年加死亡后50年；法人及其它組織的作品，其法律規(guī)定的相關(guān)著作權(quán)的保護(hù)期為50年。

軟件專利只能申請發(fā)明專利，保護(hù)期限從申請日起算20年。